Pat MacDonald est surtout célèbre pour avoir été chanteur, guitariste et compositeur principal du groupe Timbuk3, nommé pour le Grammy Away du Meilleur Nouvel Artiste en 1987. Il forma ce duo avec sa femme de l'époque, Barbara K. MacDonald, en 1984 à Madison, Wisconsin, avant de s'installer à Austin, Texas la même année. Le groupe de sépare en 1995, date depuis laquelle il poursuit une carrière solo, qu'il mène de front aux Etats-Unis et en Europe.
Pat MacDonald a également écrit des chansons pour ou avec Cher, Keith Urban, Imogen Heap,
Stewart Copeland du groupe The Police, Peter Frampton, et le compositeur japonais Ryuichi Sakamoto. Des chansons qu'il a écrites ou co-écrites ont été interprétées par
Aerosmith, Oysterhead, Cher, Jools Holland,
Billy Ray Cyrus, Night Ranger, Pavarotti.
En 2005, il co-fonda le Steel Bridge Songfest, un concert caritatif annuel et festival d'auteurs/compositeurs se tenant dans sa ville de résidence actuelle de Sturgeon Bay, Wisconsin.