Edward Furlong nait à Glendale dans l'État de Californie, d'un père inconnu et d'une mère nommée Danielle Tafoya, qui est d'origines mexicaines. En 1990, il va vivre avec sa tante Nancy Tafoya et son oncle Sean Furlong, qui deviennent ses tuteurs légaux en 1991. Il fréquente ensuite la Charles W. Eliot Middle School de Pasadena puis la South Pasadena Junior High School.
En 1991, alors qu'il ne possède pas l'ambition de devenir comédien, le jeune Edward Furlong est contacté par un agent artistique pour tenir le rôle de John Connor dans
Terminator 2 : Le Jugement dernier de
James Cameron, au côté d'
Arnold Schwarzenegger. Âgé de seulement 14 ans, il accède alors très vite à la renommée et enchaîne les projets. Il s'illustre consécutivement dans le film d'horreur
Simetierre 2, le film policier American Heart et le thriller
Little Odessa.
En 1996, l'Américain figure au générique du thriller Le Poids du déshonneur, réalisé par
Barbet Schroeder, puis tente une incursion dans la comédie en tenant la vedette du
Pecker de John Waters, aux côtés de
Christina Ricci.
En 1998, il incarne le jeune frère d'
Edward Norton dans
American History X avant d'accompagner
Willem Dafoe et
Steve Buscemi dans la prison d'
Animal Factory.
En 2002, Edward Furlong est à l'affiche du thriller franco-britannique
Une souris verte..., signé par Mathias Ledoux dans lequel il côtoie
Emilia Fox et
Elsa Zylberstein.
Bien loin de ses débuts dans Terminator 2 : Le Jugement dernier, Edward Furlong s'est tourné vers un cinéma plus indépendant, ne tournant que dans de petites productions. Il apparaît cependant dans 2 épisodes de la saison 3 des Experts : Manhattan en 2006. Il reprendra ce même rôle dans 2 autres épisodes de la saison 6 et dans le 1er de la saison 7 en 2010. Il tourne ensuite dans le film de
Michel Gondry,
Le Frelon vert, adaptation de la série télévisée éponyme. Le film est prévu pour 2011.
Furlong a eu des relations connues avec
Natasha Lyonne, Jolene Blalock, et
Paris Hilton,. Il se marie avec l'actrice Rachael Bella le 19 avril, 2006. Leur fils Ethan Page Furlong nait le 21 septembre 2006. Le 8 juillet 2009, Rachael Bella demande le divorce après 3 ans de mariage.