Helen Elizabeth Hunt est la fille de Gordon Hunt, producteur et professeur d'art dramatique. Elle prend des cours assez tôt, dès l'âge de 8 ans, avec son père. Elle débute sa carrière d'actrice un peu plus d'un an après, en jouant dans plusieurs téléfilms, ainsi qu'au théâtre.
Sa notoriété démarre début 1992, grâce à la série Dingue de toi, pour laquelle elle obtiendra 4 Emmy de la meilleure actrice dans une série comique sur 7 nominations, ainsi que 3 Golden Globe de la meilleure actrice dans une série comique sur 6 nominations. Tandis que la série Dingue de toi est toujours en production, elle incarne Jo Harding, une femme à la tête d'une équipe de météorologues, dans le blockbuster Twister, réalisé par Jan de Bont.
L'année qui suit, James L. Brooks réalise Pour le pire et pour le meilleur et lui propose le rôle de Carol Connelly, où elle incarne une serveuse dans un restaurant et mère d'un petit garçon gravement malade. Le
film est apprécié par les critiques, et l'année suivante, Helen remporte le Golden Globe de la meilleure actrice dans un film musical ou une comédie ainsi que l'Oscar de la meilleure actrice, alors que la favorite était Kate Winslet pour
Titanic.
Après avoir côtoyé Jack Nicholson dans Pour le pire et pour le meilleur, elle côtoie Richard Gere, où elle est Bree, une jeune professeur qui aidera le Docteur Travis, dans
Docteur T et les femmes. Helen continue dans la comédie et elle joue aux côtés de Mel Gibson dans Ce que veulent les femmes, où elle incarne Darcy McGuire, une femme choisie pour être la nouvelle directrice de création. En 2001, on lui propose le rôle de Clarice Starling, joué auparavant par Jodie Foster qui refuse de reprendre son rôle dans
Hannibal. On lui préfèrera Julianne Moore.
Helen Hunt s'est mariée en juillet 1999 à l'acteur Hank Azaria (et doubleur pour Les Simpson) pour une courte durée puisqu'ils ont divorcé un an après en décembre 2000. Elle a rencontré ensuite Matthew Carnahan en 2001 et ils ont une fille, Makena'lei Gordon Carnahan, née en 2004.
Elle se lance actuellement dans la réalisation.