Son grand-père, Georges Chaperot était scénariste (La Cage aux rossignols) et sa soeur, Armelle Patron, est scénariste à la télévision (Mademoiselle, Vous les femmes...). Ensemble ils écrivent pour le cinéma et la télévision.
En 1981, Emmanuel obtient une licence de théâtre et cinéma et en 1984 il suit le cours
Charles Dullin pendant trois ans. Emmanuel travaille aussi régulièrement lors de stages avec Philippe Hottier (Théâtre du Soleil), Élisabeth Chailloux, Adel Hakim et Bob Mc Andrew, à New York et à Paris.
Pour passer le concours de scénographe de la rue Blanche, il interviewe un metteur en scène de Théâtre qui l'engage pour jouer le rôle du précepteur dans Un mois à la campagne de Tourgueniev. Il découvre le métier de comédien et intègre le cours Charles Dullin.
En 1986, il crée sa compagnie de théâtre et joue dans les théâtres municipaux de la banlieue parisienne, de province et plusieurs fois au festival d'Avignon.
En 1993, il est remarqué dans Les Palmes de Monsieur Schutz.