Né d'un père psychanalyste, Santiago Amigorena passe son enfance en Argentine, puis en Uruguay et, en 1973, il s'installe en France avec sa famille.
Il débute sa carrière cinématographique par l'écriture du scénario du film, La Jalousie, de
Christophe Loizillon, avec qui il collabore deux autres fois, en 1997 et 2002.
Il signe une vingtaine de scénarios, notamment pour la nouvelle génération de réalisateurs français des années 1990, entre autres,
Cédric Klapisch,
Laurence Ferreira Barbosa,
Brigitte Roüan, Agnès Merlet,
Jean-Pierre Limosin avant la réalisation, en 2006 de son 1er film, Quelques jours en septembre.
Depuis 1998, Santiago Amigorena rédige sa bouleversante autobiographie. Avec quatre livres déjà parus, Une enfance laconique, Une jeunesse aphone, Une adolescence taciturne et Le Premier Amour, il nous narre les sentiments d'exclusion de l'enfant ne parlant pas, l'exil et sa vie en France, l'initiation au français pour, au 4e, en arriver aux émois de son premier amour.