En 1980, il fait son entrée dans l'univers du cinéma en tant qu'ingénieur du son, de 1982 à 1992, il travaille sur 24 longs métrages, notamment Y a-t-il un Français dans la salle ? et
Le Paltoquet de
Jean-Pierre Mocky ,
La Lectrice et Nuit d'été en ville de
Michel Deville, ou Une Époque formidable... de Gérard Jugnot. En 1993, il se décide à passer à la réalisation en dirigeant Tombés du ciel , une comédie satirique.
Attaché à des acteurs fétiches, comme
Jacques Gamblin ou
Sandrine Bonnaire, Lioret alterne longs et courts métrages à son rythme. Il choisit ses sujets, privilégiant les thèmes sombres et profonds, comme dans L'Équipier, en 2004, pour lequel il aura trois nominations aux Césars. En 2006, nouveau succès avec Je vais bien, ne t'en fais pas, primé aux Césars. En 2009, il réalise Welcome, film engagé et sensible sur le thème des migrants, qui rencontre l'approbation du grand public.
En 2010, il se mobilise pour la cause des travailleurs sans-papiers en grève aux côtés de nombreux cinéastes et artistes.