À l'instar de son collègue Michel Gondry, mais dans un autre registre, Spike Jonze est intéressé par les paris risqués. Produire une fausse troupe de danse (très) amateur pour Fatboy Slim, plonger Björk dans une comédie musicale classique, intégrer le groupe Weezer à un épisode de Happy Days, transformer son épouse en gymnaste professionnelle pour les Chemical Brothers. Ce genre de préoccupations trouve depuis quelques années un souffle nouveau dans deux parties très distinctes du travail de Jonze : son oeuvre de cinéaste, d'un côté, et de l'autre, son oeuvre en tant que producteur de la série Jackass pour MTV, où des cascadeurs professionnels se mettent en péril de manière drôle et bête.
En tant qu'acteur, Spike Jonze a joué dans le film Les Rois du désert (Three Kings).
Il a été marié à la réalisatrice Sofia Coppola de 1999 à 2003.
Il collabore souvent avec le scénariste Charlie Kaufman.
En 2009, il adapte le célèbre livre pour enfants de Maurice Sendak, Max et les maximonstres. Le
film est sorti en salle le 16 décembre 2009.